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为九校联盟、中国乐虎唯一app官方下载校长联谊会、Universitas 21、环太平洋乐虎唯一app官方下载联盟、21世纪学术联盟、国际应用科技开发协作网、新工科教育国际联盟成员，入选“珠峰计划”、“强基计划”、“111计划”、“2011计划”。

卓越医生教育培养计划、卓越法律人才教育培养计划、卓越工程师教育培养计划、卓越农林人才教育培养计划、国家建设高水平乐虎唯一app官方下载公派研究生项目、中国政府奖学金来华留学生接收院校、学位授权自主审核单位。

学校创建于1896年，原名南洋公学，1911年更名为南洋乐虎唯一app官方下载堂，1929年更名为国立交通乐虎唯一app官方下载，1949年更名为交通乐虎唯一app官方下载；

1957年经历西迁与分设，分为交通乐虎唯一app官方下载上海部分和西安部分；1959年，交通乐虎唯一app官方下载上海部分启用“上海交通乐虎唯一app官方下载”校名；1999年，原上海农学院并入；2005年，与原上海第二医科乐虎唯一app官方下载合并。

至2020年12月，学校共有33个学院/直属系，31个研究院，13家附属医院，2个附属医学研究所，23个直属单位，5个直属企业。至2020年9月，有博士后流动站38个，一级学科博士点47个，专业学位博士点7个，一级学科硕士点56个，专业学位硕士点31个，本科专业71个。

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设有18个研究所（以及5个分所）、7所临床医院（含与北京市共建的天坛医院）、5所学院、1个研究生院和5所分院。

“十一五”期间，承担各类科研项目共计6367项，累计获科研项目资助额达22.1亿，其中国家级科研项目资助金额占61%；累计获各类科技奖励成果199项，其中国家科学技术奖24项；累计获准专利215项，新药证书7项，位居全国医学院校之首。

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